معاونت پژوهشی معاون پژوهشی با انتخاب و حکم رئیس فرهنگستان منصوب می شود. در تاریخ 1 اردیبهشت 1404 طی حکمی از سوی آقای دکتر محمدرضا مخبردزفولی رئیس فرهنگستان علوم، آقای دکتر منصور کبگانیان به سمت "معاون پژوهشی" منصوب شد. شورای پژوهشی شورای پژوهشی متشکل از معاون پژوهشی، دبیر فرهنگستان و نمایندگان گروه های علمی فرهنگستان است. جلسات این شورا دو هفته یک بار تشکیل می شود. ریاست شورا با معاون پژوهشی است. اعضای شورا (به ترتیب حروف الفبا): - دکتر حسن احمدی (رئیس گروه علوم کشاورزی و منابع طبیعی) - دکتر محمد اسحاقی (دبیر کمیسیون مطالعات راهبردی مرجعیت علمی) - دکتر ایمان افتخاری (رئیس شبکه دانشمندان جوان) - دکتر ناصر باقری مقدم (دبیر شورای آینده نگاری) - دکتر رضا پورحسین (رئیس گروه تعلیم و تربیت) - دکتر سید مجتبی خیام نکوئی (دبیر کمیسیون مطالعات راهبردی امنیت غذایی) - دکتر نسرین سلطانخواه حقیقی (رئیس کمیسیون راهبردی زنان دانشمند) - دکتر سعید سهراب پور (رئیس گروه علوم مهندسی) - دکتر محمد شاهدی باغ خندان (سرپرست مرکز مطالعات علم و فناوری) - دکتر محمدرضا شمس اردکانی (دبیر فرهنگستان علوم) - دکتر علی اکبر صالحی (قائم مقام رئیس فرهنگستان علوم) - دکتر جواد صالحی (رئیس گروه کوانتوم و هوش مصنوعی) - دکتر سید سعید رضا عاملی (رئیس گروه مطالعات جهان) - دکتر مصطفی قانعی (رئیس گروه زیست پزشکی) - دکتر سید محمد مهدی کیایی (رئیس گروه علوم دامپزشکی) - دکتر سید مصطفی محقق داماد (رئیس گروه علوم اسلامی) - دکتر محمدرضا مخبر دزفولی (رئیس فرهنگستان علوم) - دکتر علی اکبر موسوی موحدی (رئیس گروه علوم پایه) - دکتر حسین نمازی (رئیس گروه علوم انسانی) - دکتر سید محمدرضا هاشمی گلپایگانی (رئیس گروه مهندسی پزشکی) وظایف شورای پژوهشی - مطالعه سیاست های کلان پژوهشی کشور و فرهنگستان، تدوین سیاست های پژوهشی فرهنگستان با توجه به اهداف و وظایف فرهنگستان و در راستای چشم انداز و اعلام آن به رئیس فرهنگستان - بررسی و تعیین راه های ارتباط پژوهشی فرهنگستان با مسئولان پژوهشی سازمان ها و مؤسسات پژوهشی داخل و خارج کشور - بررسی فعالیت های پژوهشی گروه های علمی فرهنگستان و ارائه پیشنهادهای لازم جهت ارتقای وضع پژوهشی آنها - تدوین آیین نامه های داخلی مرتبط با طرح ها و فعالیت های پژوهشی و نظایر آنها و ارائه به رئیس فرهنگستان - بررسی مسائل و مشکلات پژوهشی فرهنگستان - تهیه برنامه های کوتاه مدت، میان مدت و بلند مدت فعالیت های پژوهشی فرهنگستان و اعلام آن به رئیس فرهنگستان - بررسی موضوعات مرتبط با امور پژوهشی فرهنگستان ارائه شده از سوی گروه های علمی و اعلام نظر به رئیس فرهنگستان - بررسی و اعلام نظر در خصوص پیشنهاد طرح های پژوهشی جدید و اعلام به شورای علمی جهت تصویب نهایی آن - تعیین داور یا ناظر برای ارزیابی گزارش های مرحله ای و نهایی طرح های پژوهشی - اظهار نظر در مورد نتایج حاصل از طرح های پژوهشی و اعلام به شورای علمی جهت تصویب نهایی و تسویه حساب با مدیر طرح - مطالعه و بررسی آیین نامه ها و دستور العمل ها و برنامه های علمی و پژوهشی و ارائه پیشنهادهای لازم - مطالعه و بررسی امور ارائه شده از سوی معاون پژوهشی و ارائه پیشنهادهای لازم - مطالعه و بررسی و اعلام نظر در رابطه با امور محوله از سوی رئیس فرهنگستان و شورای علمی