معاونت پژوهشی معاون پژوهشی با انتخاب و حکم رئیس فرهنگستان منصوب می شود. در تاریخ 1 اردیبهشت 1404 طی حکمی از سوی آقای دکتر محمدرضا مخبردزفولی رئیس فرهنگستان علوم، آقای دکتر منصور کبگانیان به سمت "معاون پژوهشی" منصوب شد. شورای پژوهشی شورای پژوهشی متشکل از معاون پژوهشی، دبیر فرهنگستان و نمایندگان گروه های علمی فرهنگستان است. جلسات این شورا دو هفته یک بار تشکیل می شود. ریاست شورا با معاون پژوهشی است. اعضای شورا (به ترتیب حروف الفبا): - دکتر غلامرضا اعوانی (نماینده گروه علوم اسلامی) - دکتر ناصر باقری مقدم (دبیر شورای آینده نگاری) - دکتر مگردیچ تومانیان (نماینده گروه علوم پایه) - دکتر محمد شاهدی باغ خندان (رئیس مرکز مطالعات علم و فناوری) - دکتر محمدرضا شمس اردکانی (دبیر فرهنگستان) - دکتر حسن ظهور (نماینده گروه علوم مهندسی) - دکتر سیدمهدی قمصری (نماینده گروه علوم دامپزشکی) - دکتر منصور کبگانیان (معاون پژوهشی) - دکتر فرشاد مؤمنی (نماینده گروه علوم انسانی) وظایف شورای پژوهشی - مطالعه سیاست های کلان پژوهشی کشور و فرهنگستان، تدوین سیاست های پژوهشی فرهنگستان با توجه به اهداف و وظایف فرهنگستان و در راستای چشم انداز و اعلام آن به رئیس فرهنگستان - بررسی و تعیین راه های ارتباط پژوهشی فرهنگستان با مسئولان پژوهشی سازمان ها و مؤسسات پژوهشی داخل و خارج کشور - بررسی فعالیت های پژوهشی گروه های علمی فرهنگستان و ارائه پیشنهادهای لازم جهت ارتقای وضع پژوهشی آنها - تدوین آیین نامه های داخلی مرتبط با طرح ها و فعالیت های پژوهشی و نظایر آنها و ارائه به رئیس فرهنگستان - بررسی مسائل و مشکلات پژوهشی فرهنگستان - تهیه برنامه های کوتاه مدت، میان مدت و بلند مدت فعالیت های پژوهشی فرهنگستان و اعلام آن به رئیس فرهنگستان - بررسی موضوعات مرتبط با امور پژوهشی فرهنگستان ارائه شده از سوی گروه های علمی و اعلام نظر به رئیس فرهنگستان - بررسی و اعلام نظر در خصوص پیشنهاد طرح های پژوهشی جدید و اعلام به شورای علمی جهت تصویب نهایی آن - تعیین داور یا ناظر برای ارزیابی گزارش های مرحله ای و نهایی طرح های پژوهشی - اظهار نظر در مورد نتایج حاصل از طرح های پژوهشی و اعلام به شورای علمی جهت تصویب نهایی و تسویه حساب با مدیر طرح - مطالعه و بررسی آیین نامه ها و دستور العمل ها و برنامه های علمی و پژوهشی و ارائه پیشنهادهای لازم - مطالعه و بررسی امور ارائه شده از سوی معاون پژوهشی و ارائه پیشنهادهای لازم - مطالعه و بررسی و اعلام نظر در رابطه با امور محوله از سوی رئیس فرهنگستان و شورای علمی